此《意见》分六大部分：一、适应农业发展新阶段的需要，切实加强农业政策法制工作；二、加强农业政策调研，提高为决策服务的水平；三、按照世贸组织规则，加快农业立法进程；四、加强农业执法监督，全面提高执法水平；五、强化农业行政执法，继续搞好综合执法试点；六、努力为农业政策法制工作创造良好的环境。
《意见》中说，今年农业部要组织部内司局及地方农业部门，对农业结构的战略性调整、农民增收、应对加入世贸组织、农村劳动力流动、农业管理体制、粮食流通体制改革和农村金融体制改革等重点问题进行研究。农业部软科学委员会要充分利用社会各方面的人力资源，重点就工农关系、城乡关系、提高农产品质量安全水平、税费改革与乡村管理体制、农村经济组织建设、农业执法体系建设、农业科技创新与推广体系建设、扩大优势农产品出口等问题进行重点研究。各省农业部门政策法制工作机构，要围绕上述调研题目及本地区党政领导机关的决策需要，组织力量开展调研，提出的政策建议要切实可行，对当地农村改革与发展有指导意义，对全国农村改革与发展有借鉴作用。
《意见》指出，各级农业部门要在继续抓好与世界贸易组织有关的农业法规、规章清理和修改工作的基础上，抓好农业法律法规的起草工作，建立和完善符合世界贸易组织规则要求、支持和保障国内农业发展的法规体系。重点加强有关支持农业发展、保障农产品质量安全、以及确立农业生产经营主体法律地位方面的立法。各级农业部门要加强农业行政执法体系建设，建立一支高素质的农业行政执法队伍，做到执法管理目标化、执法行为规范化、执法程序公开化、执法监督经常化。农业部决定今年下半年在全国范围内开展农业行政执法大检查，重点检查是否重视农业法制工作，法制机构和执法队伍是否健全，案件处理是否合法规范，监督制度是否完备。各级农业部门要统一思想，提高认识，顾全大局，加强组织领导，整合执法力量，加大综合执法力度。农业部决定进一步扩大试点范围，继续在部分县、市开展农业综合执法试点。农业综合执法在本级农业部门的业务范围内进行，不跨部门综合。综合的职能主要是有关法律、法规、规章赋予农业部门的行政处罚权，其他职能是否集中，由各地根据当地情况决定。综合执法的重点在县一级。各级农业部门在抓好日常性执法工作的同时，要以农资市场准入管理、农产品质量安全监督管理为重点，加大法力度，充分发挥综合执法队伍的作用。
该《意见》最后强调，各级农业部门要以江泽民同志“三个代表”重要思想为指导，按照党的十五届六中全会、中央经济工作会议和中央农村工作会议精神，进一步转变职能、工作作风和工作方法，切实把农业部门的职能转到经济调节、行政执法、政策落实和公共服务上来。要增强政治意识、大局意识、责任意识和改革意识，提高工作质量和效率。要加强学习，不断提高政治、业务素质，努力把农业政策法制工作提高到一个新水平。
