种子是农业生产的基本生产资料，是农业科技的重要载体，是保证作物产量和质量的根本内因，控制种子，就掌握了农业竞争的主动权。现在农业生产实践已证明，种子对种植业产量增长的贡献率达到了30%-40%，可见其产生的社会效益之巨大。为充分发挥首都农业科技辐射源的作用，“抓亲本、控源头、保良种”是目前发展北京农业、推进种业发展的首要之举。
目前在北京的农作物繁种面积并不大，蔬菜共有原原种、原种繁种基地5000-6000亩，小麦种子面积5－10万亩，玉米制种约1.5万亩。
尽管北京作物育种的面积不大，但是具有劳动者素质高，资金雄厚，规模与机械化程度高等优势，已具备了生产高质量种子的条件。经过多年的努力，北京种业基本形成了“三中心、一平台”的发展的基本格局。目前全国种子交易额共300亿左右，北京市种子交易额占35亿元左右，占10%以上，其中北京市进行的进出口种子交易额为8000万美元，占总全国总交易额的40％以上。
全国种业科研育种中心。我国保存的种质资源36万余份，中国农业科学院长期库储存种质资源数量就达到33.4万份，隶属35科192属712种，保存数量居世界各种质库首位。另外，首都聚集全国实力最强的种业科研、教学、育种机构，有一定育种规模的大专院校和企业80多家，从事育种的专家有300多人，从事育种的专业人员有1000多人。2001-2005年，国家审定通过的795个农作物品种，首都单位选育或参加选育的有86个，占10.8％。
全国种业交易贸易中心。2004年在首都的部级发证种子企业28家（全国162家），占17.3％；农业部发证从事种子育繁推销一体化的种子企业9家，占全国13.4％；外资企业14家（全国70家），占全国的20％；有进出口权的企业10家（全国74家），占全国的13％。全国10大种子企业我市占2家；50强企业5家，占全国10％，市级发证企业52家，区县发证企业214家，经营品牌种子企业579家。迄今为止在中国登记的外国独资或合资种子公司有60余家，在北京市登记的就有14家。
全国种业信息中心。行业服务机构，为种子企业、科研育种单位提供政策、品种、生产、供求、价格等信息；种子行业门户网站“中国种子网、中国种业信息网、北京种业信息网”；“中国种业”行业刊物；“种业动态咨询”国内唯一的直投刊物；北京种子交易会已连续成功举办12届，每届参会企业达1000多家，交易额6亿元以上，已成为了解我国蔬菜种子生产供应和价格变化的“晴雨表”。
农业育种基础研究创新平台。为保持北京在农业育种领域的优势和地位，北京市科委于2005年在全国率先建立了有45个单位参加、18家中央单位参与的开放的北京农业育种基础研究创新平台，该平台聚集了多位院士和国内外200余名高水平专家，对农业育种领域的重大基础理论和关键技术进行攻关。该平台以其具有的开放性、集成性特点，促进了科技资源的集约化应用，提高了科技条件资源和科技成果的产出率。首批支持的玉米和小麦项目现均已取得了突破性进展。玉米领域，已审定玉米新品种14个，苗头品种9个，其中2007年开展的“玉米雨养种植配套节水技术示范工程”，推广应用了其中审定的京单28、京科308、农大86等高产、耐旱玉米新品种，应用面积85万亩，亩可节水50方；在二系杂交小麦高产制种关键技术研究方面，新选育超高产优质杂交小麦新组合8份，审定小麦新品种4个，率先在国际上选育出冬性二系杂交小麦新组合—京麦6号，为二系杂交小麦大面积制种奠定基础。
